4月28日，巴斯德研究所發布新聞公告，該所已完成“法國輸入性與早期傳播病毒的朔源分析”相關研究，研究結果于近日以預發表發布在bioRxiv.org網站。

根據該研究，法國暴發的新冠肺炎疫情并不是由1月份來自中國的輸入病例引起的，也并非來自意大利，而是來自一種在當地傳播的來源不明毒株。 該研究由法國國家呼吸道感染病毒參考中心主任西爾維·范·德維爾和巴斯德研究所RNA病毒進化基因組學負責人埃蒂安·西蒙·洛里埃共同牽頭。

根據巴斯德研究所提供的新聞稿，繼去年12月武漢市出現新冠肺炎疾病后，法國于1月10日開始病毒監測，由巴斯德研究所和法國呼吸病毒研究所（NRC）負責啟動密切關注流程。

法國于1月24日發現首例新冠病毒感染者，這也是歐洲首例新冠肺炎患者，另有其他兩例中國輸入性病人也很快被檢測和收治。法國政府迅速采取措施，追蹤了這些患者的密切接觸者，阻止了病毒的進一步傳播。1月份的中國輸入病例沒有在法國引發局部傳播，顯示出法國采取預防病毒擴散系列措施的有效性。

法國采集的新冠病毒樣本均儲存在國家呼吸病毒研究所，巴斯德研究所RNA病毒進化基因研究組對97份法國病毒樣本進行了基因測序與比對。

樣本主要為鼻咽拭子和痰液，采樣時間為1月24日至3月24日。法國該階段確診病例22302人，死亡1100人，疫情主要流行于法國北部。

全部樣本均采自于有臨床癥狀的確診患者，同時將籍貫、旅行史、發病時間、病毒載量和采樣部位納入基因比對內容。另有3份來自阿爾及利亞病毒樣本。

法國3月疫情主要地區分布圖

法國新冠肺炎樣本單核酸多態性發生部位比較圖

根據歐洲精準醫療平臺首席科學家鞠麗雅對該溯源研究的解讀，圖中顯示：

1、取自法國東南部并有意大利旅行史的病毒株（GE1583，B2340）與法國北部的不同，但和意大利北部流行株類似，而且沒有在法國流行；

2、法國首例武漢患者（IDF0372），其單核酸多態性 G22661T是獨有的，與法國的所有病毒基因不同；

3、法國北部地區的代表性病毒基因為 GE1973 （東大地區）， IDF2849（大巴黎地區） 和 N2223 （諾曼底地區）；

4、有歐洲旅行史的代表基因為 IDF2792；

5、3份取自阿爾及利亞的病毒株與法國北部流行株同源。

巴斯德研究所將法國檢測的樣本序列與全球共享流感數據倡議組織（GISAID）發布的338份新冠肺炎病毒序列進行比對和溯源分析，并建立病毒進化樹圖譜。

對比研究表明，法國流行的新冠病毒和1月發現的中國輸入感染病毒并非來自同一毒株，兩種病毒來自同一個“祖先”，但屬于不同的分支。導致法國本地疫情的主流分支，和來自中國和意大利的輸入病例都不相同。

法國現今流行的病毒樣本中，最早一個樣本是2月19日從一名患者身上采集的，該患者沒有國內外旅行史，也沒有和海外歸國的旅行者接觸過。該患者于2月25日去世，隨后法國出現大規模疫情潮。

來自不同地區病毒進化樹

鞠麗雅對科技日報記者表示，從圖中可以看到：

來自亞太地區（包括湖北武漢）的病毒株與法國病毒株沒有關聯；

來自美國病毒株與法國的關聯不大；

法國北部流行病毒株（不同地區有不同彩色）均出自于同一原始株。

用通俗的話來解 釋，法國新冠病毒是一個歷史久遠的大家族，和中國武漢的病例相隔甚遠。

綜合上述結果，巴斯德研究團隊提出，由于最有代表性的基因型的最早病例并沒有旅行史，意味著早在2月份歐洲疫情爆發之前，已經有病毒在法國和歐洲其他國家“悄然”流行，且大部分是輕癥或無癥狀，因而長時間未被發現。這項工作為法國病毒溯源提供了線索，并強調在無癥狀病例大量存在的情況下，遏制病毒傳播面臨挑戰。

巴斯德研究所指出，許多國家的病毒取樣工作仍然不完全，因此無法精確估算出法國新冠病毒的來源或輸入時間。

蒂安·西蒙·洛里埃指出，“根據我們的首次觀察，法國流行的新冠病毒感染與無癥狀病例有關。對不同地區的新冠病毒進行測序很重要，以便能更好地了解法國新冠病毒的流行軌跡。”

來源：科技日報

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