來源:科技日報
2021-07-15 01:06:07
原標題:實施基因精準編輯 畢赤酵母變高效“細胞工廠”
來源:科技日報
實施基因精準編輯 畢赤酵母變高效“細胞工廠”
科技日報訊 (記者郝曉明)7月12日,記者從中國科學院大連化學物理研究所獲悉,該所研究員周雍進團隊在畢赤酵母方面的研究取得新進展,構建了基因編輯工具,強化了同源重組從而實現了基因精準編輯,鑒定了染色體基因整合位點并表征了系列不同表達強度的啟動子,發展了雙因素調控策略調控了脂肪醇生物合成。相關研究成果發表在《核酸研究》上。
甲醇酵母的代表性菌株畢赤酵母以甲醇為“食物”,其具有高密度發酵的優點,每個細胞就像一個催化工廠,在生產脂肪醇等人類所需化合物方面具有潛在價值。構建畢赤酵母細胞工廠,往往需要將外源基因植入細胞基因組中,讓植入基因實現表達。然而,基因的隨機重組大大降低了外源基因的“移植成功率”。同時,外源基因的隨機插入,或將導致細胞死亡或功能受損。此外,成功“打入”細胞內部的外源基因,或由于缺乏啟動子而不能正常表達,導致了“顆粒無收”。
針對這些問題,研究團隊強化了畢赤酵母同源重組效率,發現了限制同源重組修復的關鍵基因RAD52,其高表達能將單基因編輯效率提升至90%。此后,研究團隊發現,敲除MPH1基因可以使多片段重組效率提升13.5倍。在此基礎上,他們鑒定出46個可用于外源基因整合的中性位點,這些中性位點可以放置外源基因且不影響細胞功能;鑒定并表征了18個常用啟動子的表達情況。
研究團隊發現,不同啟動子和中性位點的組合會導致脂肪醇產量的巨大差異,由此發展出雙因素調控策略,實現了脂肪醇合成效率的調控,其中最高產量和最低產量的差異達到30倍。歷時3年,研究團隊建立了畢赤酵母高效基因編輯系統。
周雍進表示,理論上,該系統可以在1個畢赤酵母穩定裝載超過100個外源基因,并能實現基因表達的精準調控,為畢赤酵母的合成生物學研究提供便利,也為其他非常規酵母代謝工程改造提供借鑒。
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