來源:農民日報
2021-01-19 07:18:01
原標題:聯合破譯德州驢基因組
來源:農民日報
日前,由山東省農業科學院與東阿阿膠股份有限公司主導,聯合國內外多家單位共同合作的“德州驢基因組開發及其產業化應用”項目傳來捷報,該項目團隊已獲得國際首個組裝到染色體水平的家驢基因組參考圖譜,其研究成果于2020年12月9日在Nature子刊《Nature Communications》在線發表,為馬屬動物遺傳資源保護和利用以及家驢基因組育種和遺傳改良提供了重要理論支撐。
驢產業是我國特色產業,在世界上具有領先優勢。作為名貴中藥材“阿膠”的重要原料供體,驢不僅是畜牧業中的重要一員,也是醫療康養界的“明星”。作為阿膠產業核心省份的山東,為深入挖掘優良品種“德州驢”的遺傳資源,進一步提升遺傳資源利用水平,山東省農科院聯合東阿阿膠股份有限公司,于2014年底聯合發起了“德州驢基因組開發及其產業化應用”項目,經過5年多的不懈攻關,最終成功構建了德州驢染色體水平的高質量參考基因組圖譜。該參考基因組用到了二代測序、三代測序和染色體構象捕獲技術,其ScaffoldN50達到93.37Mb,是目前奇蹄目馬屬動物中連續性最好的參考基因組。
我國大型優良驢品種多為深毛色,小型驢品種及野驢多為淺毛色,其背后的分子機制對于培育優良驢品種具有重要意義。德州驢作為深毛色優良率品種,其基因組不僅為馬屬動物的起源進化研究提供了數據基礎,也為優良遺傳資源保護和利用、家驢基因組選擇育種和遺傳改良、家驢分子設計育種提供了數據支撐。
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