來源:工人日報
2019-12-13 06:35:12
本報訊(記者黃哲雯)近日,《自然-遺傳學》以兩篇長文形式在線發表了兩項由中國農科院領銜開展的瓜類作物基因組研究成果。兩項研究分別構建了甜瓜和西瓜的全基因組變異圖譜,揭示了兩種水果的馴化歷史及果實品質的遺傳分子機制。上述成果的發表,將進一步強化我國在瓜類作物基因組學與分子育種領域的國際領先地位。
據介紹,中國農科院鄭州果樹研究所徐永陽研究團隊聯合中國農科院深圳農業基因組研究所、西班牙巴塞羅那基因組中心及中國農科院蔬菜花卉研究所、青島農業大學、中國農業大學、美國康奈爾大學、法國農業科學院等19個國內外科研機構,歷時5年共同構建了世界第一個甜瓜全基因組變異圖譜,首次系統闡釋了甜瓜的復雜馴化歷史及重要農藝性狀形成的遺傳基礎。
甜瓜研究團隊分析了千余份甜瓜種質資源的基因組變異,共鑒定了560萬個SNP。在此基礎上,發現甜瓜可能發生過三次獨立的馴化事件,其中一次發生在非洲地區,另外兩次發生在亞洲地區并分別產生了厚皮甜瓜和薄皮甜瓜兩個栽培亞種。三次獨立馴化“異曲同工”,都導致野生甜瓜失去苦味和酸味并獲得了甜味。此外,通過全基因組關聯分析等手段,定位了200余個與甜瓜苦味、酸味、果實大小、果肉顏色等性狀相關的候選基因和位點。
另外,中國農科院深圳農業基因組研究所黃三文研究團隊協同鄭州果樹研究所、北京市農林科學院、美國康奈爾大學組成聯合攻關團隊,采用單分子測序、光學圖譜與Hi-C三維基因組聯合分析,完成了高質量的西瓜基因組序列圖譜,繼而對400多份種質資源開展了基因組變異分析,共鑒定近2000萬個SNP。此外,鑒定獲得了與果實含糖量、瓤色、形狀等性狀關聯的43個信號位點,提供了關鍵候選基因。
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